nokkahuilun sävelreiät on yleensä ajateltu aseteltavan säännöllisin väliajoin, mutta todellisuudessa näin ei ole.
ne eivät ole tasaisin väliajoin, eivätkä ne ole kaikki suorassa linjassa. Reiät eivät ole suorassa linjassa, koska ne on sijoitettu niin, että ne on helpompi peittää sormilla.
sillä edellytyksellä, että ne on sijoitettu samalle korkeudelle porauksessa, syntyy sama äänenkorkeus riippumatta siitä, missä ne on sijoitettu poran kehälle kyseisellä korkeudella. Jos sormia yrittää venyttää, huomaa, että ihmiskädessä keskisormea ja nimettömää on vaikeampi venyttää kuin muita sormia. Siksi nokkahuilun reikien asentoa varten myös keskisormen ja nimettömän peittämien reikien välinen tila minimoidaan.
sävelkorkeuden ja reikien koon mukaan kaikkien reikien paikat on tarkasti säädetty niin, että ne on helppo peittää sormilla.

esimerkkinä sävelaukkojen asentojen ja niiden koon välisestä suhteesta voidaan todeta, että jos reiän asentoa siirretään kauemmas nauhurin poraa alaspäin, äänen sävelkorkeus voidaan säilyttää vain tekemällä reiästä suurempi. Kääntäen, kun reikä on uudelleensijoitettu ylempänä poraa, se on suunniteltu pienemmäksi.
jos puisessa nokkahuilussa havaitaan, että sävelkorkeus on lopullisessa virityksessä hyvin vähän ulkona, reiän kokoa hienosäädetään veitsellä.